VarID依据基因表达谱的类似性将细胞连接起来，并在部分类似细胞群中量化基因表达的变异性（或噪音）。
近来，德国马克斯 普朗克研讨所的Dominic Grün研讨员提出了一种根据单细胞数据量化必需基因表达变异性的办法。这种名为VarID的办法可以在十分类似或相关的细胞状况间丈量基因表达的噪音，协助研讨人员更好地了解生物噪音对细胞发育调理，乃至是细胞分解的必要程度。相关论文宣布在《天然 办法》杂志上。
细胞是生命的柱石，为了更深化地了解不同的细胞类型及其分子进程，科学家们会运用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技能来丈量单个细胞中活泼基因发作的mRNA分子数量。就像指纹相同，在一个特定的细胞中，每个基因的mRNA分子数量决议了细胞的身份以及细胞之间的联系。
“许多疾病，比方癌症，首要是因为细胞没有彻底发育老练，仍处于干细胞的前期阶段，不受操控地分散。咱们想要了解当发育以这种办法遭到搅扰时，细胞内会发作什么。因而，咱们研发了处理和剖析单细胞数据的共同算法。”研讨人员表明。
在细胞的发育进程中，必需基因，例如调理基因开关的转录因子，往往只要弱小的表达，有时在同一类型的细胞中还具有高度的变异性，科学家们称这种现象为“生物噪音”，因而，很难再数据中检测到这些基因表达的差异。此外，现在可用的剖析办法简直彻底集中于量化并解说单个细胞内的基因表达水平。可是，在细胞分解和细胞状况改变进程中基因表达噪音的生物学含义还没有正真取得深化的研讨。
本研讨中的VarID，可以量化十分类似或相关的细胞状况间的基因表达噪音，其中心是Dominic Grun开发的一种算法，该算法从单细胞RNA测序数据中量化了基因表达变异性的动态改变。在不同的细胞类型或细胞状况的杂乱混合物中，VarID描绘了具有差异基因表达可变性的附近区域。重要的是，这种办法还能提醒与细胞状况改变相关的弱小而喧闹的转录因子的活性。
经过VarID，研讨人员就有或许探究在干细胞向老练细胞类型分解进程中基因表达噪声的动态改变，并研讨生物噪音对调控细胞发育、乃至是细胞分解的必要程度。在针对小鼠血细胞发育的研讨中，研讨人员使用VarID追寻了小鼠血细胞发育所必需的转录因子的活性。“多个方面数据显现，已知在小鼠骨髓老练血细胞中表达的重要转录因子在血液干细胞中的表达量很低且具有高度变异性。咱们咱们都以为这些基因网络的动摇，也便是这些基因的噪音，可以触发血液干细胞的分解。” Dominic Grun说。
Dominic Grun坚信，基因表达噪音是决议细胞命运的要害部分。“VarID为说明基因表达噪音在干细胞分解进程中的效果打开了一扇门。已然咱们现在可以解读干细胞分解的噪音，接下来咱们咱们都期望可以发现这样的一个进程是怎么操控的，以便更好地了解噪音怎么调理细胞命运决议。”
科界原创
编译：花花
审稿：alone
