撰文：常熟理工李杰
订正：武汉病毒所石正丽 转载留言即可
由于新冠病毒大迸发，病毒学研讨被逼走出试验室，成为了群众餐前饭后的论题。谨慎的试验科学被放大为社会新闻，这给病毒科学带来了极大的困扰！
任何范畴的科学研讨都不是一蹴而成的。依据某一试验现象发现的效果往往并不是问题的终究答案，但却是处理问题的关键步骤。只要依据各大试验室不断报导的最新效果，全世界的科学家才干齐心协力一起推动问题的终究处理。
群众新闻往往不具备满足的科学素养，当然更多是为了寻求流量。他们看到某一发布的试验效果，为了投合热门当即进行各种态度的解读宣扬。这给当时新冠病毒的研讨和科学家自己都带来了许多困扰。生命科研前沿大众号近期推出名家系列文章，从科学的视点报导科学家2019年的科研效果，希望有时机能够引导更多目光重视科学自身。
石正丽研讨员是我国出名的病毒学家。现任我国科学院武汉病毒研讨所研讨员、美国微生物科学院Fellow、武汉病毒所学术委员会主任、新发流行症研讨中心主任、武汉国家生物安全试验室（四级）副主任、新发病毒学科组组长。
石正丽研讨员团队首要以新发病毒病原学及其感染机理为首要研讨方向，包含蝙蝠、啮齿动物等野生动物中新病毒的发现与判定、冠状病毒等重要动物源病毒的分子流行病学、遗传进化与跨物种感染分子机理研讨；重要新发病毒的血清学与分子确诊技能的树立；蝙蝠抗病毒免疫研讨。
在此，咱们总结了2019年石正丽研讨员团队在新发病毒病原学及其感染机理范畴的研讨效果（通讯作者文章），石正丽研讨员团队效果大致上能够分为以下三个部分：
一、病毒筛查
二、病毒血清学
三、总述
病毒筛查
1、Nature Microbiology：新式蝙蝠丝状病毒的发现和特征判定[1]
丝状病毒，尤其是埃博拉病毒（EBOV）和马尔堡病毒（MARV），其致病性强和致死率高，被归为生物安全四级病毒。从前研讨效果证明蝙蝠是MARV的天然宿主，而Lloviu病毒（LLOV）和邦巴利病毒（BOMV）的发现标明蝙蝠或许带着有更多新式丝状病毒。在该文章中，我国科学院武汉病毒研讨所石正丽研讨员团队联合杜克-新加坡国立大学医学院王林发院士团队对新发现的一株蝙蝠丝状病毒（命名为：勐腊病毒，MLAV）进行了特征判定。
勐腊病毒的遗传判定a. 不同丝状病毒的基因组结构；b.根据丝状病毒L蛋白的体系发育剖析
经过高通量测序技能和传统PCR扩增了该病毒的基因组编码区序列，全长为18,330bp，同其他丝状病毒相同，该基因组次序编码NP, VP35, VP40, GP, VP30, VP24和 L基因。在基因组水平，该病毒同已知丝状病毒类似度为32%-54%，根据世界病毒分类委员会的分类规范，该病毒归于丝状病毒科新属、新种，命名为滇丝病毒属（Dianlovirus）勐腊病毒种（MLAV）。在遗传进化关系上，MLAV更接近于MARV，由于其GP基因不存在翻译移码。经过CRISPR-Cas9技能证明了MLAV同其他丝状病毒相同运用尼曼匹克C1（NPC1）为受体。根据最小基因组技能，证明了MLAV的仿制酶体系能够同EBOV和MARV交换。一起MLAV的假病毒能够侵略多种宿主来历的细胞，标明MLAV存在跨种感染的危险。
2、Frontiers inMicrobiology：肯尼亚啮齿动物和鼩鼱新式RNA病毒的分子检测和遗传特性研讨[2]
大多数新发或许再现的人畜共患病的病原体是RNA病毒。啮齿动物和鼩鼱是多种人类病原体的宿主，如汉坦病毒、拉沙热病毒、副粘病毒等。虽然存在这些要挟，但人们对在肯尼亚啮齿动物和鼩鼱之间传达的病毒多样性知之甚少，这在某种程度上预示着这些小型哺乳动物迸发流行症的危险或许会被忽视。该文章经过分子检测手法研讨了在肯尼亚与人类有高潜在触摸区域的啮齿动物和鼩鼱带着的RNA病毒多样性的监测效果。从138只啮齿动物和5只鼩鼱的粪便、尿液和安排中共收集617个样本，运用RT-PCR办法对这些样本中是否含有8个病毒科的病毒进行筛查。该研讨中检测到的病毒多为新式毒株，部分归于含有重要人类病毒病原体的宗族。有必要留意一下的是,一种新的沙粒病毒在Grammomys macmillani中被发现，这是初次在该动物上发现沙粒病毒。这些发现标明，需求在这些小型哺乳动物以及软弱和露出的牲畜和人类中继续监测病原体。这将有助于在肯尼亚等具有丰厚野生生物多样性的国家拟定和施行有用的新发流行症防备和操控战略。
该研讨在肯尼亚沿海区域、裂谷区域、西部区域三个代表区域进行了啮齿动物和鼩鼱带着RNA病毒的监测
3、PLOS Neglected Tropical Diseases：我国云南小型哺乳动物中温州哺乳动物沙粒病毒(WENV)病毒的感染状况查询[3]
在非洲和美洲，哺乳动物病毒与人类出血热疾病有关。最近一种新的哺乳动物沙粒病毒（Wenzhou mammareavirus, WENV）及其相关病毒,已在我国,柬埔寨和泰国被发现。在柬埔寨，这些病毒被置疑与人类疾病有关。在我国，云南省以其丰厚的动植物多样性而出名，且与东南亚几个国家接壤。因而，有必要了解与WENV相关的病毒或其他哺乳动物病毒在云南省是否普遍存在。研讨效果标明与WENV相关的病毒在云南省的小型哺乳动物中有传达。对5个病毒株的全基因组序列剖析标明，这些病毒与在亚洲发现的WENV病毒密切相关，在WENV分支的体系发育树上构成一个独立的分支。在相关区域来查询这些病毒对公共卫生的影响至关重要。
该研讨在云南省多个县市收集小型哺乳动物样本展开沙粒病毒监测
4、Viruses：菊头蝠中发现一个新的具有共同基因组特征的Alpha冠状病毒成员[4]
蝙蝠被认为是各种冠状病毒(CoVs)的天然宿主。其间一些已经过种间传达在人和牲畜中引起疾病。考虑到蝙蝠冠状病毒、蝙蝠品种和种群的多样性，咱们希望经过病毒监测发现更多的蝙蝠冠状病毒。在本研讨中，咱们描绘了蝙蝠alphaCoV (BtCoV/Rh/YN2012)中一个具有共同基因组特征的新成员。在S基因和E基因之间发现了共同的基因ORF4a和ORF4b，而在N基因下流发现了ORF8基因。一切估测的基因均经反转录剖析进一步证明。BtCoV/Rh/YN2012基因组3 '结尾的一个共同基因ORF9，与SARS相关的冠状病毒ORF7a具有约30%的氨基酸同源性。功能剖析显现ORF4a蛋白质能够激活IFN-β出产,而ORF3a能够调理NF-κB出产。该研讨效果扩展了对蝙蝠冠状病毒遗传多样性的知道。对蝙蝠病毒的继续筛查将有助于咱们进一步了解蝙蝠在冠状病毒进化和传达中的及其重要的效果。
不同株的蝙蝠冠状病毒BtCoV/Rh/YN2012与蝙蝠冠状病毒HKU10的基因组各个ORF方位比较
病毒血清学
1、Emerging Microbes & Infections：肯尼亚骆驼中发现MERS冠状病毒和HKU8相关冠状蛋白共感染的血清学依据[5]
单峰驼是各种冠状病毒的重要宿主，包含导致人类感染的中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)。在感染期间，冠状病毒基因组有规则地进行重组，正如在蝙蝠SARS相关冠状病毒中观察到的那样。在这里，咱们初次报导了肯尼亚MERS-CoV 囊膜刺突蛋白受体结合域（RBD）抗体阳性的骆驼血清中，只要一小部分对MERS-CoV核衣壳蛋白(N)呈阳性。相比之下，其间许多样本含有抗蝙蝠HKU8相关冠状病毒（HKU8r-CoVs）N蛋白的抗体。在584个对MERS-CoV RBD呈阳性的骆驼样本中，咱们发现只要48(8.22%)个样本对MERS-CoV N蛋白呈阳性。但是，咱们在MERS-CoV RBD阳性、N蛋白阴性样本中却发现73例(12.5%)中有HKU8r-CoV N蛋白抗体阳性，而在相同的样本中仅发现3例(0.43%)HKU8r-CoV S1抗体阳性。这些发现或许标明在骆驼中一起感染MERS-CoV和HKU8r-CoV。这也或许提高了重组冠状病毒在肯尼亚传达的或许性，该病毒具有MERS-CoV的S基因和HKU8r-CoV的N基因。咱们未能找到HKU8r-CoV或重组病毒的分子依据，但咱们的发现应该能协助其他研讨者寻找到HKU8r-CoV或重组的分子依据。
大部分MERS-CoV刺突蛋白受体结合区（RBD）抗体阳性的骆驼血清中检测不到MERS-CoV的NP蛋白抗体。a. MERS-CoV RBD与NP蛋白抗体的ELISA筛查效果。b. 根据荧光素酶免疫沉淀体系（LIPS）的MERS NP蛋白抗体检测效果。c. Western blot验证NP抗体阳性/阴性的血清样本。
总述
1、Nature ReviewsMicrobiology：致病性冠状病毒的来源与演化[6]
严峻急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)是21世纪初出现在人类体内的两种高传染性、致病性病毒。这两种病毒都或许来源于蝙蝠，而与SARS-CoV和MERS-CoV相关的遗传多样性冠状病毒在全球范围内的蝙蝠中被发现。在这篇总述中，咱们总结了现在关于这两种致病性冠状病毒的来源和演化的常识，并评论了它们的受体运用;咱们还强调了蝙蝠传达的冠状病毒的多样性和外溢潜力，最近猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)对猪的外溢便是依据。
不同冠状病毒的基因组结构与编码蛋白示意图
参考文献
[1].Characterization of a filovirus (Měnglà virus) from Rousettus bats in China, Nature Microbiology
[2].Molecular Detection and Genetic Characterization of Novel RNA Viruses in Wild and Synanthropic Rodents and Shrews in Kenya,Frontiers in Microbiology
[3].Prevalence of Wenzhōu virus in small mammals in Yunnan Province, China, PLOS Neglected Tropical Diseases
[4].Characterization of a New Member of Alphacoronavirus with Unique Genomic Features in Rhinolophus Bats, Viruses
[5].Serological evidence of MERS-CoV and HKU8-related CoV co-infection in Kenyan camels, Emerging Microbes & Infections
[6].Origin and evolution of pathogenic coronaviruses, Nature Reviews Microbiology
往期热门
1.新冠病毒“撸猫”不“舔狗”，病毒究竟能否经过宠物传达？
2.抗疫防疫新思路—检测污水中的冠状病毒
3.运用夏天按捺疫情或许无望！
4.难以想象：简简单单的橘子皮或可防治新冠病毒
5.绵长寒假完毕！江苏33所高校开学时刻汇总！
我就知道你在看！
