单细胞测序技能是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序剖析的技能。单细胞测序技能可以在组学水平提醒细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追寻技能位居2018年Science杂志评选的十大科学打破之首。惯例单细胞转录组测序技能丢掉了细胞在原安排中至关重要的空间方位信息，而单细胞空间转录组技能在进行单细胞转录组测序的一起保存并记录了细胞的空间方位信息。空间转录组技能可以提醒细胞间的相互作用以及细胞所在的微环境，将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学、肿瘤微环境等范畴的研讨利器。
11月12日，《核酸研讨》（Nucleic Acids Research）在线宣布了中国科学院生物物理研讨所高通量测序中心标题为SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes的论文，发布榜首个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化渠道。SpatialDB体系收录了来自5个物种由8种空间转录组技能发生的数据，建立了空间转录组数据剖析处理流程，完成了空间转录组数据的在线可视化，一起供给了空间差异表达基因及其功用富集剖析的注释。
中科院院士、生物物理所研讨员陈润生以及高级工程师陈小伟为论文一起通讯作者。生物物理所高通量测序中心高级工程师范珍为论文榜首作者。该研讨取得中科院要害技能人才项目、国家自然科学基金和国家重点研制项目的赞助。
生物物理所开发单细胞空间转录组数据剖析可视化渠道
来历：中国科学院生物物理研讨所
